بررسی چندشکلی نشانگر SSR در بین ارقام بی‌بذر، کم‌بذر و بذر‌دار گونه‌های مختلف جنس Citrus

Authors

  • رفعت , فرهاد موسسه تحقیقات مرکبات کشور، رامسر
  • عدولی, بابک موسسه تحقیقات مرکبات کشور، رامسر
  • گل‌محمدی, مرتضی موسسه تحقیقات مرکبات کشور، رامسر
Abstract:

Simple sequence repeats (SSR) polymorphism in citrus including male sterile, sterile, low fertile and fertile was examined by analyzing 28 representative accessions sampled from north of Iran. Fifty four polymorphic alleles with an average of 4.2 alleles per primer were detected from eight pairs of used primers. The lowest number of alleles was observed in TAA27, CTT01, CCSM18 and ATC09 loci with only three alleles and the highest number of alleles was observed in TAA15 locus with eight alleles. Polymorphic information content (PIC) values changed from 0.34 (AG14) to 0.90 (CCSM18). Genetic similarities among accessions were calculated according to Jaccard Similarity Index and used to construct a dendrogram based on the unweighted pair group method using arithmetic averages (UPGMA) which put the 28 samples into four major groups (A, B, C and D). The cultivars of male sterile Satsuma mandarin were clustered into group A those of orange, grapefruit and Page (a complex hybrid) into group B mandarin cultivars into group C and lemon Lisbon into group D.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

بررسی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیک برخی گونههای جنس زعفران موجود در ایران با استفاده از نشانگر RAPD

زعفران ( . Crocus spp ) از جمله گیاهان بومی ایران است که دارای خواص دارویی و ادوی های متعدد می باشد و به لحاظ اقتصادی در ایران و جهان حائز اهمیت است. یکی از کاربردهای مهم تکنیک های مولکولی بررسی و برآورد سطح تنوع ژنتیکی در ژر مپلاسم ها و جمعیت ها، برای استفاده مطلوب از آن ها در به نژادی و مدیریت حفظ ذخایر ژنتیکی گیاهان می باشد. به این منظور در تحقیق حاضر تنوع و ارتباط ژنتیکی 25 نمونه از زعفران ...

full text

بررسی چندشکلی نشانگرهای مولکولی SSR و ISSR در نژادگان‌های مختلف لیموترش بدون علائم بیماری جاروک

لایم‌ها به دلیل کیفیت و اسیدیتۀ بالای عصارۀ میوه، به‌صورت تازه خوری و فرآوری شده استفاده می‌شود. در سال‌های اخیر، رخداد بیماری جاروک، باعث بین رفتن هزاران اصله درخت لایم در جنوب ایران ‌شده است. مهم‌ترین روش کنترل این بیماری، کاشت نژادگان (ژنوتیپ)های متحمل است. بنابراین، در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 33 نژادگان مختلف لایم بدون علائم بیماری جاروک در مزرعه یا پس از آزمایش‌های مقدماتی، به‌همراه ده رقم ...

full text

شناسائی ارقام برگرداننده و نگهدارنده باروری در برنج با استفاده از نشانگر SSR

در اصلاح نباتات کلاسیک به‌نژادگران ارقام برگرداننده‌کننده باروری را از طریق تست کراس ارقام موجود با لاین‌های نر عقیم سیتوپلاسمی (CMS) و ارزیابی نتاج F1 از نظر باروری دانه گرده و خوشه مورد شناسائی قرار می‌دهند. لاین‌هایی که نتاج آن‌ها باروری خوشه و دانه گرده بیش از 80 درصد را نشان دهند به‌عنوان لاین‌های برگرداننده در نظر گرفته می‌شوند. در این مطالعه 15 رقم برنج در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه علوم کشا...

full text

بررسی چندشکلی ژنوتیپ‌های مرکبات با استفاده از نشانگر مولکولی رپید

شناسایی تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی، برای دست‌یابی به ارقام مطلوب در مرکبات مهم و ضروری است. در این پژوهش از نشانگرRAPD جهت تعیین تنوع ژنتیکی میان 29 ژنوتیپ مرکبات استفاده شد. 19 آغاز‌گر استفاده شده تعداد 248 باند چند شکل ایجاد گردید که بیشترین باند تکثیر شده 19 عدد و مربوط به آغازگر OPA-07 بود، در حالیکه آغازگر 05-OPA با هشت باند کمترین قطعات چندشکل را نشان داد. متوسط تعداد باند چند‌‌‌‌شکل ب...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام مختلف گلرنگ با استفاده از صفات مورفولوژیک و نشانگر ریز ماهواره ssr

مطالعه تنوع ژنتیکی برای اجرای برنامه‏های به‏نژادی گیاه گلرنگ کاربردی می‏باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی تنوع ژنتیکی با استفاده از داده‏های مورفولوژیکی و نشانگر ssr بود. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی، مطالعه روابط بین صفات و گروه‏بندی ژنوتیپ‏ها، آزمایشی در قالب طرح بلوک‏های کامل تصادفی در 3 تکرار و با استفاده از 20 ژنوتیپ گلرنگ(6 ژنوتیپ تهیه شده از ایران و 14 ژنوتیپ خارجی) انجام شد. صفات مورفولوژیک...

بررسی تنوع ژنتیکی برخی ارقام گل داوودی (.Chrysanthemum morifolium Ramat) با استفاده از نشانگر مولکولی ریزماهواره (SSR)

آگاهی از تنوع ژنتیکی، پیش­شرط اصلی و اولین گام در اصلاح گیاهان می‌باشد. در همین راستا، این پژوهش به بررسی تنوع ژنتیکی 20 رقم گل داوودی (.Chrysanthemum morifolium Ramat) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR پرداخته است. نشانگرهای مورد استفاده، در مجموع توانستند 731 باند با اندازه 128 تا 404 جفت باز ایجاد کنند. تعداد باند در آغازگرهای مختلف، دامنه­ای از 22 تا 96 عدد باند در ارقام مورد بررسی بود. میان...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 3  issue 10

pages  205- 215

publication date 2014-02

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023